En 1947, la Mission Méthodiste, guidée par William Thonger acquiert ce domaine appartenant auparavant à la Famille Fallot et fonde ainsi le Centre Méthodiste. Dans ce cadre enchanteur, de nombreux enfants ont pu oublier, le temps d'un camp de vacances, les horreurs de la seconde guerre mondiale. Le chalet Fallot ne sera rasé qu'en 1973, bien après que le bungalow (tout droit issu de l'Exposition universelle de Bruxelles) ne soit installé. C'est également dans les années 70 que le Centre Méthodiste prend le nom de Centre Protestant d'Amougies. De même, c'est dans ces années-là que le pavillon devient ce qu'il est aujourd'hui. Nous sommes reconnus depuis 1985 par la Fédération Wallonie Bruxelles comme Centre de Rencontre et d'Hébergement. Le Complexe d'Hébergement William Thonger a, lui, ouvert ses portes en 1995. En 2014, l'annexe de ce bâtiment a été inaugurée, proposant au public les salles Wuyts et Fallot, un studio ainsi qu'un espace sanitaire pour l'aire de scoutisme. En 2020, la Conciergerie devient, à son tour, un bâtiment d'hébergement.
Nos partenaires protestants sont : l'Eglise Protestante Unie de Belgique, le Service Protestant de la Jeunesse et le Centre Protestant de Waarfaz.